En un futuro próximo, una subida repentina e inexplicable del mar ha dejado a gran parte de la civilización humana bajo el agua. Ikaruga Natsuki, un niño que perdió a su madre y una de sus piernas en un accidente algunos años antes, regresa desilusionado de una dura vida en la gran ciudad. Sin familia, lo único que tiene a su nombre es el barco y el submarino que le dejó su abuela oceanóloga y sus deudas. El futuro que ha perdido es aprovechar una oportunidad que le presentó la sospechosa cobradora de deudas Catherine. Zarpan para buscar en las ruinas hundidas del laboratorio de su abuela para encontrar un tesoro que, según los rumores, ella dejó allí. no riquezas ni joyas; es una chica extraña que yace dormida en un ataúd en el fondo del mar, Atri es un robot, pero su apariencia y su riqueza de emociones engañarían a cualquiera haciéndole creer que es un ser humano vivo.